По итогам заседания Совета по науке и образованию, состоявшегося 20 декабря 2013 года, Правительству Российской Федерации было поручено обеспечить сохранение структурной целостности, имущества и кадровых ресурсов организаций, находившихся в ведении Российской академии наук, Российской академии медицинских наук и Российской академии сельскохозяйственных наук, в течение года со дня их передачи в ведение Федерального агентства научных организаций.
Данный вопрос рассмотрен на заседании Совета при Президенте Российской Федерации по науке и образованию 08.12.2014, по итогам которого главой государства поручено (№ Пр-3011, п.2е, от 27.12.2014) Правительству Российской Федерации обеспечить сохранность в составе Федерального агентства научных организаций имущества, закреплённого за подведомственными ему научными организациями, кроме случаев, определённых решениями Президента Российской Федерации, а также сохранение объёма бюджетных ассигнований федерального бюджета, предусмотренных Агентству на финансирование этих научных организаций.