Федеральным законом предусматривается, что Водный кодекс Российской Федерации вступает в силу с 1 января 2007г.
Федеральным законом сохраняется действие выданных и заключенных до 1 января 2007г. лицензий на водопользование и договоров пользования водными объектами до истечения указанных в них сроков. Вместе с тем устанавливается возможность по желанию водопользователей переоформить указанные документы на предусмотренные Водным кодексом Российской Федерации договоры водопользования или решения о предоставлении водных объектов в пользование.
Кроме того, определяются меры, направленные на реализацию требований Водного кодекса Российской Федерации. Например, перечисляются земельные участки, в пределах которых расположены пруды и обводненные карьеры, относящиеся к собственности Российской Федерации, субъектов Российской Федерации и муниципальных образований.